ỨNG DỤNG CHỈ THỊ ITS TRONG NHẬN DIỆN LOÀI MÃ TIỀN (Strychnos nitida) TẠI THANH HÓA
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Vùng ITS (Internal Transcribed Spacer) là một chỉ thị phân tử được sử dụng phổ biến trong định danh thực vật nhờ khả năng phân giải tốt ở cấp độ loài, cho phép phân biệt các loài có hình thái tương đồng. Do đó, ITS đóng vai trò quan trọng trong kiểm định chất lượng, bảo tồn và nghiên cứu phân loại loài thực vật. Nghiên cứu này phân lập, giải trình tự và phân tích phát sinh chủng loại vùng ITS của loài Mã tiền (Strychnos nitida) thu tại Pù Luông, Thanh Hóa. Trình tự ITS thu được từ mẫu nghiên cứu có kích thước 724 bp, được phân tích so sánh với các trình tự tham chiếu trên GenBank và cây phát sinh chủng loại, cho thấy, mẫu nghiên cứu có quan hệ di truyền gần với S. nitida và các loài cùng chi Strychnos. Kết quả khẳng định ITS là chỉ thị phân tử hữu ích trong nhận diện loài Mã tiền và có thể ứng dụng trong kiểm soát chất lượng dược liệu.
Từ khóa
Mã tiền, Strychnos nitida, chỉ thị ITS, mã vạch DNA, nhận diện loài.
Chi tiết bài viết
Tài liệu tham khảo
[2] Sambrook J, Fritsch ER, Maniatis T, (1989), Molecular cloning: A laboratory manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY.
[3] Stoeckle M, (2003), Taxonomy, DNA, and the bar code of life, BioScience, 53(9): 796-797.
[4] Mishra PK, Kumar A, Nagireddy A, Mani S, Shukla R, Tiwari AK, (2021), DNA barcoding: an efficient tool for authentication of medicinal plants, Plant Gene, 25: 100262-100262.
[5] Chen S, Yao H, Han J, Liu C, Song J, Shi L, Zhu Y, Ma X, Gao T, Pang X, Luo K, Li Y, Li X, Jia X, Lin Y, Leon C, (2010), Validation of the ITS2 region as a novel DNA barcode for identifying medicinal plant species, PLoS ONE, 5(1):e8613, doi.org/10.1371/journal.pone.0008613.
[6] Kumar S, Stecher G, Sulesky M, Sanderford M, Sharma S, Tamura K, (2024), MEGA12: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms for adaptive and green evolution, Mol. Biol. Evol., 41(12): msae283. doi: 10.1093/molbev/msae263.
[7] Pandit S, Sharma S, Joshi CS, Kumar R, Kumar D, Kumar M, (2023), DNA metabarcoding using rbcL and ITS2 markers for medicinal plant identification, bioRxiv: 1-15, doi:10.1101/2023.07.05.547729.
[8] Kuete V, (2020), Medicinal plant research in Africa: Pharmacology and chemistry, 2nd ed., Elsevier, Amsterdam, Netherlands.
[9] Yang S, Chen S, Mo J, J. Han, Liu C, Luo X, Zhou X, (2024), Application of DNA barcoding to identify medicinal plants, J. Vis. Exp., 1-12. doi:10.3791/65483.
[10] Yu J, Wu X, Liu C, Zhang Y, Liu Z, Wang Y, Zhang Y, (2020), Progress in the use of DNA barcodes in the identification and classification of medicinal plants, Environ. Sci. Pollut. Res., 27(34):42963-42972.