Thanh bên bài viết

Số lượt xem tóm tắt: 1
DOI: 10.70117/hdujs.81.11.2025.1088
Số xuất bản
Số 81-11.2025: Khoa học Nông - Lâm - Ngư nghiệp
Chuyên mục
Khoa học Nông - Lâm - Ngư nghiệp
Trích dẫn bài báo
Nguyễn, V. H., Lê, Đình C., & Lê, T. L. (2025). Xây dựng cơ cở dữ liệu barcode rpoB cho cây Mật gấu (Vernonia amygdalina Del.) tại Thanh Hóa. Tạp chí Khoa học Trường Đại học Hồng Đức, 81(11). https://doi.org/10.70117/hdujs.81.11.2025.1088

Xây dựng cơ cở dữ liệu barcode rpoB cho cây Mật gấu (Vernonia amygdalina Del.) tại Thanh Hóa

Nguyễn Việt Hải1, TS. Lê Đình Chắc2, , Lê Thị Lâm2
1 Trung tâm nghiên cứu dược liệu Bắc Trung bộ, Viện dược liệu
2 Trường Đại học Hồng Đức

Nội dung chính của bài viết

Tóm tắt

Chỉ thị phân tử (DNA barcode) được sử dụng để nhận diện các loài thực vật dược được xem là phương pháp có độ tin cậy cao và tính ứng dụng rộng rãi. Đặc biệt, đối với các loài có giá trị về dược học. Vì vậy, DNA barcode trở thành công cụ không thể thiếu trong nghiên cứu phân loại và bảo tồn. Về bản chất, DNA barcode là một trình tự DNA có chiều dài khoảng 400-1000 bp được sử dụng làm chỉ thị phân tử để xác định quan hệ phát sinh chủng loài và nhận diện loài một cách nhanh chóng, chính xác, không phụ thuộc vào đặc điểm hình thái của các mẫu sinh vật. Trong nghiên cứu này, chúng tôi tiến hành phân lập, xác định trình tự và quan hệ di truyền của gene ropB loài cây Mật gấu (Vernonia amygdalina Del.) làm cơ sở cho các nghiên cứu tiếp theo. Kết quả giải trình tự đoạn gene ropB có kích thước 506 bp, được sử dụng để phân tích so sánh trình tự rpoB đã công bố trên GenBank cho thấy đoạn gene rpoB của mẫu nghiên cứu có quan hệ di truyền tách biệt hoàn toàn khỏi các nhóm khác của các trình tự rpoB đã công bố. Kết quả này đã chứng minh trình tự gene rpoB của các mẫu nghiên cứu có độ sai biệt di truyền đáng kể so với các trình tự gene rpoB trên GenBank. Điều này cho thấy độ tin cậy và chính xác khi sử dụng đoạn gene rpoB để xác định quan hệ di truyền của loài cây Mật gấu (Vernonia amygdalina Del.).

Từ khóa

DNA barcode, Mật gấu, đoạn gene rpoB, Mã vạch DNA.

Chi tiết bài viết

Tài liệu tham khảo

[1] Allen, G. C, Flores-Vergara M. A, Krasynanski. S, Kumar. S, and Thompson W. F, (2006) “A modified protocol for rapid DNA isolation from plant tissues using cetyltrimethylammonium bromide,” Nat Protoc., vol. 1, pp. 2320-2325.
[2] Farombi, E.O. & Owoeye, O. (2011). Phytochemistry and medicinal properties of Vernonia amygdalina. Journal of Medicinal Food, 14(12), 1310–1316.
[3] Hollingsworth, P. M., Forrest, L. L., Spouge, J. L., Hajibabaei, M., Ratnasingham, S., van der Bank, M., … Little, D. P. (2009), “A DNA barcode for land plants”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 106(31), 12794-12797. https://doi.org/10.1073/pnas.0905845106
[4] Mark W. Chase; Nicolas Salamin; Mike Wilkinson; James M. Dunwell; Rao Prasad Kesanakurthi; Nadia Haider; Vincent Savolainen, (2005). Land plants and DNA barcodes: Short-term and long-term goals. Philosophical Transactions of the Royal Society B, 360, 1889-1895.
[5] M. Stoeckle, (2003) “Taxonomy, DNA, and the Bar Code of Life,” BioScience, vol. 53, no. 9, pp.796-797.
[6] Kress, W. J., & Erickson, D. L. (2007). A two-locus global DNA barcode for land plants: The coding rbcL gene complements the non-coding trnH-psbA spacer region. PLoS ONE, 2(6), e508.
[7] S. Kumar, G. Stecher, M. Sulesky, M. Sanderford, S. Sharma, and K. Tamura, “MEGA12: Molecular Evolutionary Genetic Analysis Version 12 for Adaptive and Green Computing,” Molecular Biology and Evolution, vol. 41, no. 12, msae263, 2024.
[8] Yeap SK, Ho WY, Beh BK, Ng KT, Abdul AB, Syamsumir DF, Koh SP, Thomas NF, and Husain K. (2010). Anticancer and immunomodulatory properties of Vernonia amygdalina. Pharmaceutical Biology, 48(11), 1162–1169.