SỬ DỤNG CHỈ THỊ DNA BARCODE ĐỊNH LOẠI LOÀI KHỔ SÂM (Croton SP.) ĐƯỢC THU HÁI TẠI XẪ NHƯ XUÂN, TỈNH THANH HOÁ
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Sử dụng các chỉ thị phân tử (DNA barcode) để nhận diện các loài sinh vật nói chung, các loài thực vật dược nói riêng luôn có độ tin cậy cao. Đặc biệt là các loài quý hiếm, loài có giá trị trong thực tiễn. Về bản chất, DNA barcode là kỹ thuật sử dụng một trình tự DNA (khoảng 400-1000 bp) như một chỉ thị để xác định quan hệ chủng loài và nhận diện các loài sinh vật một cách nhanh chóng và chính xác và có thể nhận diện các loài thực vật dược giả mạo hoặc các loài quý hiếm cần được bảo tồn,… Do vậy, vấn đề này đang được sự quan tâm đặc biệt của các nhà khoa học trong và ngoài nước, đặc biệt là những loài đồng hình, hoặc những mẫu vật chưa phát triển hoàn thiện, hoặc những mẫu không có hình thái nguyên vẹn. Vì vậy, trong bài viết này, chúng tôi đề cập đến việc nhận diện loài Khổ sâm (Croton sp.) bằng trình tự DNA barcode trnH. Kết quả đã phân lập và xác định được trình tự của kích thước của gene trnH. Thông qua việc so sánh với các dữ liệu trên ngân hàng gen, trình tự nucleotide của gene này được xác định là loài Croton kongensis.
Từ khóa
DNA barcode, Croton sp., gene trnH, trnH.
Chi tiết bài viết
Tài liệu tham khảo
1. Bộ Y tế, Dược điển Việt Nam V (2018), tập 2. Nhà xuất bản Y học.
2. Đỗ Tất Lợi, Cây thuốc Việt Nam (2006). Nhà xuất bản Y học.
3. G. C. Allen, M. A. Flores-Vergara, S. Krasynanski, S. Kumar, and W. F. Thompson, (2006) “A modified protocol for rapid DNA isolation from plant tissues using cetyltrimethylammonium bromide,” Nat Protoc., vol. 1, pp. 2320-2325.
4. K. Tamura, G. Stecher, and S. Kumar, (2021) “MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 11,” Molecular Biology and Evolution, vol. 38, pp. 3022-3027.
5. Kress WJ, Wurdack JK, Zimmer EA, Weigt LA, Janzen DH: Use of DNA barcodes to identify flowering plants. Proc Natl Acad Sci USA. 2005, 102: 8369-8374. 10.1073/pnas.0503123102.
6. L. Sun, Z. Meng, Z. Li, B. Yang, Z. Wang, G. Ding, and W. Xiao, (2014) “Two new natural products from Croton kongensis Gagnep,” Nat Prod Res, vol. 28, no. 8, pp. 563-567.
7. M. J. Wang, M. Wang, X. Q. Zhan, L. Liu, Q. Wu, F. L. An, Y. B. Lu, L. L. Guo, Z. X. Zhang , and D. Q. Fei, (2023) “Antimicrobial diterpenoids from the leaves and twigs of Croton kongensis Gagnepain,” Fitoterapia, vol. 164, Art. no. 105350.
8. M. Stoeckle, (2003) “Taxonomy, DNA, and the Bar Code of Life,” BioScience, vol. 53, no. 9, pp.796-797.
9. R. Z. Fan , L. Chen , T. Su , W. Li , J. L. Huang , J. Sang , G. H. Tang , and S. Yin, (2021) “Discovery of 8,9- seco- ent-Kaurane Diterpenoids as Potential Leads for the Treatment of Triple-Negative Breast Cancer,” J Med Chem, vol. 22, no. 64(14), pp. 9926-9942.
10. Sambrook, J., Fritsch, E. R., & Maniatis, T. (1989). Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2nd ed.). Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
11. T. T. Dao, K. Y. Lee, H. M. Jeong, P. H. Nguyen, T. L. Tran, P. T. Thuong, B. T. Nguyen, and W. K. Oh, (2011) “ent-Kaurane diterpenoids from Croton tonkinensis stimulate osteoblast differentiation,” J Nat Prod., vol. 74, no. 12, pp. 2526-2531.
12. Y. Y. Fan, S. Q. Shi, G. Z. Deng, H. C. Liu, C. H. Xu, J. Ding, G. W. Wang, and J. M. Yue, (2020) “Crokonoids A-C, A Highly Rearranged and Dual-Bridged Spiro Diterpenoid and Two Other Diterpenoids from Croton kongensis,” Org Lett, vol. 7, no. 22(3), pp. 929-933.